Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL1O95922 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL1O95922 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms