Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP4K4O95819 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP4K4O95819 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms