Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms