Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFASCO94856 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFASCO94856 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFASCO94856 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFASCO94856 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFASCO94856 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFASCO94856 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFASCO94856 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFASCO94856 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFASCO94856 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFASCO94856 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFASCO94856 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFASCO94856 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFASCO94856 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFASCO94856 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFASCO94856 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NFASCO94856 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms