Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALDH1A2O94788 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms