Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS26AO75436 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS26AO75436 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms