Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OPHN1O60890 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPHN1O60890 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms