Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VEGFDO43915 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFDO43915 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFDO43915 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFDO43915 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFDO43915 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VEGFDO43915 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VEGFDO43915 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms