Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ3O43525 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ3O43525 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms