Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN3O15551 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms