Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms