Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPRTO14522 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
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