Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EBAG9O00559 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms