Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAPO00193 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAPO00193 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAPO00193 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAPO00193 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAPO00193 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAPO00193 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAPO00193 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAPO00193 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAPO00193 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAPO00193 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAPO00193 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAPO00193 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAPO00193 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAPO00193 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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