Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1CA8MV81 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD1CA8MV81 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms