Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf47A7E2U8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C4orf47A7E2U8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C4orf47A7E2U8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf47A7E2U8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf47A7E2U8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf47A7E2U8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms