Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms