Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD3A6NKT7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD3A6NKT7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD3A6NKT7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms