Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SDR42E2A6NKP2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR42E2A6NKP2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR42E2A6NKP2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms