Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTL1A6NKG5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTL1A6NKG5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RTL1A6NKG5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms