Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMX3A6NHT5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HMX3A6NHT5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms