Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEIS3P1A6NDR6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms