Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP1LC3B2A6NCE7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms