Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTAGE9A4FU28 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTAGE9A4FU28 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms