Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms