Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms