Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VWA8A3KMH1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA8A3KMH1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms