Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC24A2A3L6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC24A2A3L6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms