Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRAPPC8Q9Y2L5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAPPC8Q9Y2L5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms