Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDCQ9Y266 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms