Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A2Q9UPR5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms