Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG5Q9UPR3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG5Q9UPR3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms