Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFU1Q9UMS0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFU1Q9UMS0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms