Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPDR1Q9UM22 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPDR1Q9UM22 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms