Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN2Q9ULH4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN2Q9ULH4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms