Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB23Q9ULC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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