Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC2LQ9UL33 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms