Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDV3Q9UKY7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDV3Q9UKY7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms