Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms