Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGXB4Q9UGU5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms