Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IFT172Q9UG01 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
IFT172Q9UG01 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms