Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLKQ9UBT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms