Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEMTQ9UBM1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEMTQ9UBM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms