Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ORC3Q9UBD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ORC3Q9UBD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms