Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGAP28Q9P2N2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms