Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HMG20BQ9P0W2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMG20BQ9P0W2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms