Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRN3Q9NYV6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms