Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCFC1R1Q9NWW0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HCFC1R1Q9NWW0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCFC1R1Q9NWW0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCFC1R1Q9NWW0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCFC1R1Q9NWW0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HCFC1R1Q9NWW0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms