Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM248Q9NWD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM248Q9NWD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms