Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM28Q9NW13 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM28Q9NW13 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms